高效空氣過濾器主要是作為一種工業耗材，種類及結構也很多，其中，高效空氣過濾器的高校結構又有無隔板和有隔板的區別，分別形成無隔板高效空氣過濾器和有隔板高效空氣過濾器兩種不同的類型。
無隔板的高效空氣過濾器主要采用的是熱溶膠作為濾芯的分隔物，這種以熱熔膠作為過濾器濾芯的分隔物更便于機械化的生產。加上無隔板的高效空氣過濾器體積較小、重量輕、便于安裝、效率穩定、風速均勻的特點，所以，一般情況下的潔凈廠房比較多采用的是無隔板結構的高效空氣過濾器。V型密褶式過濾器用于一般通風系統，具有過濾面積大，阻力低，使用壽命長等特點。它可做為高效過濾器的預過濾器使用，從而有效延長高效過濾器的使用壽命。
有隔板的高效空氣過濾器，主要采用的是鋁箔和紙做成的折疊狀作為濾芯的分隔物，從而形成一種空氣通道，并且分隔板還有采用優質牛皮紙的等等。其中，以鋁隔板過濾器主要用于高溫或高濕環境，紙隔板過濾器用在普通潔凈環境。并且以雙面上膠的銅版紙作分隔板，防止了分隔板受冷熱干濕的影響發生收縮從而散發顆粒，以這種為濾芯分隔物的高效空氣過濾器，同時這些分隔物又與木框或鋁合金框膠和，形成了過濾效率高、阻力低、風量大的特點。